污水生物处理实际是水体自净的强化，在去除了污水中的污染物后，必须将微生物从水中分离出来，这种分离主要是通过微生物本身的絮凝和原生动物、轮虫等的吞食作用完成的。微生物在废水处理中产生了至关重要的作用。
微生物包括：细菌、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体以及病毒，它个体微小、种类繁多、与人类关系密切。微生物应用到了食品、医药、工农业、环保等诸多领域，尤其是污水处理行业。
微生物在污水处理中产生作用实则是应用了活性污泥法。活性污泥法是一种污水的好氧生物处理法，是处理城市污水广泛使用的污水处理方法。
活性污泥法主要是使这些微生物集团----污泥在浮游状态下与排水接触，并进行处理。接触曝气法则是通过将这些微生物集团附着在接触材料上进行污水处理的。
接触曝气法中由于微生物集团时刻可以保持好的状态，因此维护管理非常方便、并且可以持续稳定的发挥其净化功能。Dorico建议将这种方式独自开发为附着式生物曝气法。
活性污泥中细菌的数量约为108～109个/ mL，它们是去除水中有机污染物的主力军。常出现的优势种群是：产碱杆菌属、芽孢杆菌属、黄杆菌属、假单孢菌属、动胶菌属，其次尚有无色杆菌、诺卡氏菌、蛭弧菌、分枝蒜苗、硝化细菌、大肠埃希氏菌等。它们全部是化能异养菌，多数为革兰氏阴性菌，可以有效地分解废水中的有机污染物。
所以说，微生物在污水处理中发挥了巨大的作用，不仅应用广泛，而且大大提高了我国每年污水处理率。
